Durante l’arco del 2009 la Fondazione ha realizzato due manifestazioni espositive di ampio respiro: la mostra ‘Dal cannocchiale al pennello. Nuova scienza e nuova arte nell’età di Galileo’ è stata aperta dal 9 maggio al 19 luglio 2009 ed è stata visitata da oltre 10.000 visitatori; la mostra ‘Chagall e il Mediterraneo’, inaugurata l’8 ottobre 2009 e rimasta aperta fino al 31 gennaio 2010, ha fatto registrare oltre 85.000 visitatori.Oltre a questi eventi, la Fondazione ha organizzato manifestazioni espositive di minor durata temporale, legate al territorio pisano, finalizzate principalmente a far conoscere aspetti meno noti dell’ambiente artistico pisano del secolo scorso e a valorizzare le collezioni della Fondazione.